PCOS导致生育障碍的直接原因就是排卵障碍，由于PCOS的病因尚不明确，从病理生理学角度分析，肥胖(尤其是中心性肥胖)、高雄激素血症和胰岛素抵抗是三个互为因果、相互促进的因素，这三个因素都可以引起排卵障碍，导致不育。
1、超重和肥胖的影响
瘦的PCOS患者也可存在胰岛素抵抗，而肥胖患者较正常体重及瘦者更为严重，也就是体重过高会增加PCOS作用，表现为高胰岛素血症及高雄激素血症，PCOS患者中超重和肥胖比例约为50%～70%。尽管一定的脂肪含量是女性生殖系统功能发育的前提，但流行病学资料显示肥胖对生育能力影响很大。尤其是在体质量指数(bodymassindex，BMI)高且为中心性肥胖时明显。过多的脂肪以及脂肪的分布都和生育能力的丧失有关，肥胖损害排卵和生育的机理还不清楚，目前普遍认为:肥胖本身不降低生育能力，肥胖导致的激素紊乱可以引起生化指标异常及卵巢功能失调，造成不排卵而致不育。超重和肥胖明显影响到体外授精－胚胎移植(invitrofertilizationandembrotransfer，IVF－ET)的治疗结局，超重和肥胖的妇女更易发生卵母细胞功能下降。几项研究结果显示经过数个IVF－ET治疗周期后，累积妊娠率随着BMI的增加而降低。
2、高雄激素血症的影响
高雄激素血症使窦卵泡发育停止、黄体生成素(luteinzinghormone，LH)峰早现、LH水平升高、颗粒细胞分化停止，从而导致卵泡成熟障碍而不排卵，继而不育。
3、高胰岛素血症和胰岛素抵抗的影响
胰岛素可与卵巢表面的胰岛素样生长因子受体结合，使卵泡膜细胞合成过多的雄激素，胰岛素抵抗还可以促进卵巢LH刺激的雄激素合成，使卵泡成熟受阻，不能排卵，从而影响生育。
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